Terveydenhuollon organisaatiot, jotka pyrkivät siirtymään pilveen, ovat enimmäkseen huolissaan muun muassa tietoturvasta ja potilaiden yksityisyydestä. Siksi on olennaista, että luotettavalla pilvipalvelun tarjoajalla on käytössään asianmukaiset tietoturvaprotokollat, jotka on suunniteltu erityisesti terveydenhuoltoalalle.
Eri alueilla on erilaiset vaatimukset siitä, miten yksityisiä tietoja tulee käsitellä terveydenhuollon asetuksissa. Palveluntarjoajien tulee tarjota palveluita ja ominaisuuksia, jotka auttavat näiden säännösten noudattamisessa.
Tämä edellyttää nykyisten terveydenhuollon tietokantojen yhdistämistä ulkopuolisiin ratkaisuihin pilven kautta, mikä voi edellyttää merkittävää teknistä osaamista ja strategista suunnittelua keskeytymättömälle tiedonsiirrolle ilman toiminnan keskeytyksiä.